เครื่องยนต์    4 จังหวะ  L-twin ระบายความร้อนด้วยน้ำ

ขนาดความจุ   1,285  ซีซี.

กระบอกสูบ x ระยะชัก   112  x 60.8  มม.

ระบบจ่ายน้ำมันเชื้อเพลิง ด้วยระบบ หัวฉีดอิเล็คทรอนิคส์

ระบบเกียร์  ธรรมดา 6 สปีด

ระบบคลัทช์ ชนิดเปียกสั่งงานด้วยระบบไฮดรอลิก

ระบบขับเคลื่อน ขับเคลื่อนด้วยโซ่และสเตอร์

ระบบเบรค

– ด้านหน้า ดิสค์เบรคคู่   คาลิเปอร์ 4 ลูกสูบ ของ BREMBO

– ด้านหลัง ดิสค์เบรคเดี่ยว คาลิเปอร์ 1 ลูกสูบ  ของ BREMBO

ระบบกันสะเทือน

– ด้านหน้า โช๊คอัพหน้าแบบเทเลสโคปิคหัวกลับ ขนาด 43 มม. ของ OHLINS NIX 30 ปรับตั้งได้ ด้วยระบบไฟฟ้า

– ด้านหลัง โช๊คอัพหลังเดี่ยวชนิดแก๊ส ทำงานร่วมกับ สวิงอาร์ม ของ OHLINS TTX 36 ปรับตั้งได้ ด้วยระบบไฟฟ้า

DUCATI 1299 Panigale S  มาพร้อมเครื่องยนต์ที่มีความจุ 1,285 ซีซี ให้พละกำลัง 205 แรงม้า แรงบิด 107 ฟุตปอนด์ ติดตั้งแพ็คเกจอิเลกทรอนิกใหม่ซึ่งประกอบด้วยระบบเบรค ABS ควบคุมในโค้งและ Ducati Wheelie Control (DWC) ระบบเกียร์สามารถปรับเปลี่ยนได้อย่างรวดเร็วขึ้นขณะสับเกียร์ลง ขณะที่ระบบ Engine Brake Control (EBC) ถูกปรับปรุงให้มีการทำงานอัตโนมัติจึงสามารถเปลี่ยนขนาดยางและอัตราทดเฟืองท้ายเพื่อการปรับแต่งเองได้

สำหรับเวอร์ชั่น 1299 S จะได้รับการติดตั้ง Ohlins Smart EC ซึ่งมีระบบควบคุมการทำงานของช่วงล่างตามสภาวะการขับขี่ ในส่วนของแชสซีส์ถูกปรับปรุงใหม่เช่นกัน มีองศาของแฮนด์เดิลบาร์ใหม่ พร้อมเพิ่มความคล่องตัวในการควบคุมตัวรถและการเกาะถนนเมื่อเทียบกับ 1199

1299 ยังมาพร้อมกับกระจกบังลมหน้าที่มีขนาดใหญ่ขึ้น ดีไซน์บั้นท้ายแบบใหม่ เบาะที่นั่งปรับปรุงใหม่ทั้งหมดเพื่อความสะดวกสบายยิ่งขึ้น ขณะเดียวกัน Ducati ยังนำเสนอ Panigale R ที่มีพละกำลังเทียบเท่ากับ 1299 คืออยู่ที่ 205 แรงม้า แต่มีแรงบิดน้อยกว่าที่ 104 ฟุตปอนด์ มีน้ำหนักตัว 172 กก. ซึ่งน้อยกว่า Panigale R รุ่นเดิมอยู่ราว 6 กก. มาพร้อมท่อไอเสีย Akraprovic ไทเทเนียม

การออกแบบภายนอกของ Ducati 1299 Panigale S ยังคงเป็นมอเตอร์ไซค์สปอร์ตดีไซน์สวยเรียบเท่ ด้านหน้ามาพร้อมไฟ LED ขนาดเล็กเป็นเส้นยาว มาตรวัดเป็นจอแบบดิจิตอลเต็มรูปแบบ ด้านข้างโชว์แฟริ่งขนาดใหญ่ครอบส่วนแฟรมและเครื่องยนต์มิดชิด และไม่เจาะช่องใด ๆ มากนัก ดูสปอร์ตสวยงามเหมือนกับมอเตอร์ไซค์แข่งทั้งหลาย มาพร้อมท่อไอเสียแบบสั้น ล้อแม็กซ์ลายสวย และไฟท้าย LED ขนาดพอเหมาะ